黃酒中含多酚物質、類黑精、谷胱甘肽等生理活性成分，它們具有自由基，防止心血管病、、抗衰老等多種生理功能。
多酚物質具有很強的自由基能力。黃酒中多酚物質的來源有兩方面，即來自原料（大米、小麥）和經過微生物（米曲霉、酵母菌）轉換。特別是由于黃酒發酵周期長，小麥帶皮發酵，麥皮中的大量多酚物質溶入酒中，因而黃酒中的多酚物質含量較高。
類黑精是美拉德反應的產物。美拉德反應是在儀器加工和貯藏過程中經常發生的反應，生成類黑精的量取決于還原糖和氨基酸的濃度。黃酒中的還原糖和氨基酸的含量高，且貯存時間長，因而生成較多的類黑精。黃酒在貯存過程中色澤變深，也與美拉德反應生成的類黑精有關。類黑精是還原性膠體，具有較強的抗突變活性。有的研究認為，其抗突變機理是致突變自由基和通過與致突變化學物結合而減少其致突變毒性。
谷胱甘肽在人體內具有重要的生理功能。當人體攝入食物中含不潔凈或等有毒物時，在肝臟中谷胱甘肽能和有毒物質結合而。谷胱甘肽過氧化酶是一種含硒酶，能體內自由基的危害。黃酒中的谷胱甘肽是發酵過程中酵母分泌和自溶產生的。酵母是提取谷胱甘肽較常用的原料，一般干酵母含1%左右的谷胱甘肽。黃酒發酵周期長，酵母自溶產生的谷胱甘肽也較多。
