飛天茅臺和五星茅臺的主要區別是商標不同。飛天茅臺和五星茅臺酒質是一樣的，只是因為早期的銷售對象不同，因此分成兩個商標，飛天商標是國外銷售，而五星商標是國內銷售。
在早些時期，我國出口的茅臺，主要以五星標的前身，車輪標的茅臺為主。但是在當時的大環境下，不少國外的人將它貼上了政治標簽，這無疑不利于茅臺的外銷。隨后，茅臺酒就借用了在西方很有名氣的，敦煌的“飛天”形象，并且沿用到了今天。
五星茅臺和飛天茅臺的區別：
1、前者不做境外銷售只對國內銷售；后者可以出口銷售到其他國家。
2、商標不同，前者使用的是麥穗圍繞著五星的商標，也是茅臺酒最初的商標；后者為了出口使用了敦煌壁畫中的飛天仙女作為商標。
3、在包裝上前者的包裝較后者較為普通；后者因為對外出口為了彰顯國酒的品質，茅臺酒廠也較重視飛天，不論是酒瓶、包裝、防偽方面都比五星好，顯得高檔一些。
4、早期由于飛天茅臺出口國內現存量很少國內很少買到，物以稀為貴，所以飛天茅臺比五星茅臺的收藏價值高些，現在的話區別不大了。
