黃酒中含豐富的蛋白質，每升紹興加飯酒的蛋白質為16g，是啤酒的4倍。黃酒中的蛋白質經微生物酶的降解，絕大部分以肽和氨基酸的形式存在，極易為人體吸收利用。
肽除傳統意義上的營養功能外，其生理功能是近年來研究的熱點之一。到目前為止，已經發現了幾十種具有重要生理功能的生物活性肽，這些肽類，具有非常重要和廣泛的生物學功能和調節功能。
氨基酸是重要的營養物質，黃酒含21種氨基酸，其中8種人體必需氨基酸種類齊全。所謂必需氨基酸是人體不能合成或合成的速度遠不適應機體需要，必須由食物供給的氨基酸。缺乏任何一種必需氨基酸，都可能導致生理功能異常，發生疾病。每1L加飯酒中的必需氨基酸達3400mg，半必需氨基酸達2960mg。而啤酒和葡萄酒中的必需氨基酸僅為440mg或更少。
